ชุดทดสอบนี้เป็น PCR เรืองแสงแบบเรียลไทม์ของ TaqMan เพื่อตรวจวัดคุณภาพ ORF1ab, กรดนิวคลีอิกของยีน N ของ 2019-nCoV ในไม้กวาดเช็ดลำคอ, เสมหะในผู้ป่วยที่สงสัยว่ามีอาการปอดบวมและกรณีคลัสเตอร์
【วัตถุประสงค์การใช้งาน】
ชุดทดสอบนี้เป็น PCR เรืองแสงแบบเรียลไทม์ของ TaqMan เพื่อตรวจวัดคุณภาพ ORF1ab, กรดนิวคลีอิกของยีน N ของ 2019-nCoV ในไม้กวาดเช็ดลำคอ, เสมหะในผู้ป่วยที่สงสัยว่ามีอาการปอดบวมและกรณีคลัสเตอร์
ผลการทดสอบมีไว้เพื่อการอ้างอิงทางคลินิกเท่านั้น และไม่สามารถถือเป็นเกณฑ์มาตรฐานสำหรับการวินิจฉัยทางคลินิกเท่านั้น ขอแนะนำให้ทำการวิเคราะห์โดยชัดแจ้งเกี่ยวกับอาการทางคลินิกและผลการตรวจทางห้องปฏิบัติการอื่นๆ
ผู้ปฏิบัติงานควรมีประสบการณ์การฝึกอบรมวิชาชีพในการขยายยีนหรือการทดสอบวิธีอณูชีววิทยา และมีคุณสมบัติที่เกี่ยวข้องสำหรับการปฏิบัติงานในห้องปฏิบัติการ ห้องปฏิบัติการควรมีข้อควรระวังด้านความปลอดภัยทางชีวภาพและขั้นตอนการป้องกันที่เหมาะสม
【หลักการทดสอบ】
ในชุดอุปกรณ์นี้ ไพรเมอร์และโพรบได้รับการออกแบบสำหรับพื้นที่อนุรักษ์และบริเวณเฉพาะของ ORF1ab, N ของ 2019-nCoV ตามลำดับ Fluorescent PCR ใช้ในการตรวจจับ RNA ของไวรัสหลังจากการทำให้กรดนิวคลีอิกบริสุทธิ์ของตัวอย่าง RNA
ชุดทดสอบนี้ใช้เทคโนโลยี PCR เรืองแสงแบบเรียลไทม์ ในระหว่างการขยาย PCR โพรบจะเชื่อมโยงกับเทมเพลต และกลุ่มผู้รายงาน 5'-end ของโพรบจะถูกแยกออกโดยเอนไซม์ Taq (กิจกรรม exonuclease 5'→3') ด้วยเหตุนี้ เคลื่อนออกจากกลุ่มดับเพื่อสร้างสัญญาณฟลูออเรสเซนต์ กราฟการขยายแบบเรียลไทม์จะถูกพล็อตโดยอัตโนมัติตามสัญญาณเรืองแสงที่ตรวจพบ และค่า Ct ของตัวอย่างจะถูกคำนวณ (จำนวนรอบที่พบเมื่อสัญญาณเรืองแสงในหลอดปฏิกิริยาแต่ละหลอดถึงเกณฑ์ที่ตัดสิน) ฟลูออโรฟอร์สีแดงของ FAM ,VIC และ Texas ถูกนำมาใช้เพื่อทำเครื่องหมายยีน ORF1ab และโพรบยีน N ในสารละลายปฏิกิริยา ด้วยการใช้การทดสอบเพียงครั้งเดียว จึงสามารถทำการตรวจหายีนทั้งสองข้างต้นของเชื้อ 2019-nCoV ในเชิงคุณภาพได้พร้อมกัน
เพื่อหลีกเลี่ยงผลลัพธ์ที่เป็นลบลวง ชุดอุปกรณ์จึงมีระบบควบคุมภายใน (IC) ซึ่งมีเครื่องหมายกลุ่มฟลูออเรสเซนต์ Cy5 ซึ่งสามารถใช้เพื่อตรวจสอบขั้นตอนการสกัดและสารละลายปฏิกิริยา
【ส่วนประกอบหลัก】
เลขที่ |
ส่วนประกอบ |
วัตถุดิบ |
ข้อมูลจำเพาะ |
1 |
ปราศจากนิวเคลียร์ น้ำ |
น้ำดีพีซี |
1,000μL ×1 หลอด |
2 |
กรดนิวคลีอิค การขยายเสียง สารละลายปฏิกิริยา |
ทริส-HCl , KCl , Mg2+ |
528μL ×1 หลอด |
3 |
ย้อนกลับ การถอดเสียง |
Reverse transcriptase, ตัวยับยั้งเอนไซม์ RNA |
48μL ×1 หลอด |
4 |
ปฏิกิริยาO/N สารละลาย |
ORF1ab, ยีน N และไพรเมอร์และโพรบควบคุมภายใน |
288μL ×1 หลอด |
5 |
การควบคุมภายใน |
ชิ้นส่วนยีนของมนุษย์ |
40μL ×1 หลอด |
6 |
การควบคุมเชิงบวก (บน) |
เวกเตอร์รีคอมบิแนนท์ที่มี ชิ้นส่วนยีนORF1ab, N |
400μL ×1 หลอด |
7 |
การควบคุมเชิงลบ |
น้ำเกลือทางสรีรวิทยา |
400μL ×1 หลอด |
8 |
ดีเอ็นเอโพลีเมอเรส |
ดีเอ็นเอโพลีเมอเรส |
50μL ×1 หลอด |
หมายเหตุ1 : ส่วนประกอบต่าง ๆ ไม่สามารถแลกเปลี่ยนได้
หมายเหตุ2 : ชุดทดสอบไม่มีรีเอเจนต์สกัดกรดนิวคลีอิก โปรดเตรียมรีเอเจนต์ก่อนใช้งาน
1. การจัดการตัวอย่าง
เพิ่ม 10μL ของการควบคุมภายในลงใน 200μL ของการควบคุมเชิงบวกและการควบคุมเชิงลบ ตามลำดับเพื่อดำเนินการสกัดกรดนิวคลีอิก
2. การเตรียมรีเอเจนต์:
การเตรียมระบบ: นำไลโอฟิไลเซอร์สำหรับขยายกรดนิวคลีอิกที่ติดตั้งไว้ล่วงหน้า จากนั้นเปิดถุงฟอยล์แล้วปั่นแยกทันที จำนวนตัวอย่างของการทดสอบแต่ละครั้งควรเป็นทวีคูณของ 8 โดยมีกลุ่มควบคุมเชิงบวกหนึ่งกลุ่มและกลุ่มควบคุมเชิงลบหนึ่งกลุ่ม เติมน้ำที่ปราศจากนิวคลีเอส 35μL ลงบนหลอดปฏิกิริยาแต่ละหลอด
3. การโหลดตัวอย่าง:
เติมกรดนิวคลีอิกตัวอย่าง5μLที่จะทดสอบ การควบคุมเชิงบวก การควบคุมเชิงลบว่าปริมาตรปฏิกิริยาทั้งหมดคือ 40 μL ในสารละลายปฏิกิริยาที่จัดสรร เพราะมันไม่จำเป็นต้องใช้ส่วนผสมที่ละเอียด และเพียงปิดฝาของหลอดปฏิกิริยา PCR แล้วหมุนเหวี่ยง ของเหลวในผนังท่อที่ด้านล่างของท่อ จึงประมวลผลการขยาย PCR
หลังจากการตรวจสอบแล้ว คาดว่าการเติมน้ำมันพาราฟิน 5μL-10μL ในระบบ PCR จะไม่ส่งผลต่อผลลัพธ์ PCR แต่หลีกเลี่ยงการปนเปื้อนและการทำให้ของเหลวกลายเป็นไอ